66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1528 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  77.78 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  70.76 
 
 		 236 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  70.76 
 
 		 236 aa  347  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  71.19 
 
 		 236 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.58 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.07 
 
 		 241 aa  304  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.07 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  63.49 
 
 		 241 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  61.86 
 
 		 238 aa  293  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  61.57 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  60.74 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  61.16 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  60.74 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  61 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  61 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  61 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  60.94 
 
 		 234 aa  284  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  60.34 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  60.25 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  60.76 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  59.24 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.17 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  57.61 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  57.61 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  57.2 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  57.32 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  57.98 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.82 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  57.68 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  58.23 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  60.5 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  57.08 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  57.08 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  58.12 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  55.42 
 
 		 296 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  57.5 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.5 
 
 		 245 aa  255  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  55.83 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  56.2 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.94 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.6 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  55.23 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  56.25 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  57.5 
 
 		 91 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  27.02 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  27.27 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  27.73 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  27.6 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  26.05 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  27.98 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838292 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06024  hypothetical protein  25.6 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.146388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  24.66 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  26.9 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  26.24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0385  glutathione S-transferase-like protein  24.2 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35431  predicted protein  23.58 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.501778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  29.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  25 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.03 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  28.92 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  28.49 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.96 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.01 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  34.21 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.15 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>