52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0121 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.98 
 
 
239 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.83 
 
 
242 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  61.48 
 
 
244 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  62.66 
 
 
242 aa  288  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  62.66 
 
 
242 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  62.24 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.34 
 
 
243 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  60.58 
 
 
242 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  59.41 
 
 
239 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  60.58 
 
 
238 aa  277  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  55.23 
 
 
236 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  56.25 
 
 
236 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  56.07 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  57.32 
 
 
232 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  62.61 
 
 
234 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  54.39 
 
 
236 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.6 
 
 
241 aa  264  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  55.88 
 
 
234 aa  264  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  58.09 
 
 
243 aa  264  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.42 
 
 
241 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.98 
 
 
236 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  54.73 
 
 
242 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.19 
 
 
241 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  54.77 
 
 
245 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  53.78 
 
 
241 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  52.89 
 
 
259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  52.89 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  52.89 
 
 
242 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  52.7 
 
 
245 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  53.33 
 
 
241 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  54.36 
 
 
241 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.07 
 
 
245 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.36 
 
 
241 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.36 
 
 
292 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  54.36 
 
 
241 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  55.42 
 
 
236 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  54.62 
 
 
238 aa  248  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  52.94 
 
 
238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  53.11 
 
 
296 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  52.94 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  52.89 
 
 
303 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  53.04 
 
 
301 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  52.48 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  30.45 
 
 
266 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  58.62 
 
 
91 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  28.33 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0838292 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06024  hypothetical protein  23.44 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.146388 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  24.79 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  27.57 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27416  predicted protein  28.05 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27489  predicted protein  28.05 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>