57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5488 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  77.78 
 
 		 232 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  73.62 
 
 		 236 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  71.06 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  71.49 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.98 
 
 		 241 aa  310  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.58 
 
 		 241 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.17 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  62.24 
 
 		 242 aa  298  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  61.83 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  62.71 
 
 		 238 aa  294  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  61.83 
 
 		 242 aa  294  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  61.83 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  62.71 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  64.58 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  62.29 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 		 292 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  61.86 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  62.5 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  60.85 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  60.5 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.24 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  59.4 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  58.58 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  58.23 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  55.88 
 
 		 244 aa  264  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  55.42 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  55.6 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  54.1 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  55.6 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  55.6 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  55.6 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.93 
 
 		 236 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.13 
 
 		 242 aa  254  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  57.14 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  54.96 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.87 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.28 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  52.92 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  50.83 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  50.83 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  52.5 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  51.25 
 
 		 284 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  58.97 
 
 		 91 aa  92.8  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  26.21 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06024  hypothetical protein  28.77 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.146388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  26.64 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  25.57 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  25.47 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  27.92 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  27.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  28.1 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  29.85 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35431  predicted protein  23.42 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.501778 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  27.74 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.1 
 
 		 220 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>