51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2420 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  67.9 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  68.05 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  69.71 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  70.12 
 
 		 242 aa  331  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  68.72 
 
 		 242 aa  327  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.32 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  61 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  64.17 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  61 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  59.34 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  56.43 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.09 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.26 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  56.43 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  56.43 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  56.43 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.61 
 
 		 236 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  61.83 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  54.32 
 
 		 245 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  58.92 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  57.68 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  54.32 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  54.73 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.11 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  54.77 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  54.36 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  57.68 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.68 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.68 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  53.53 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  55.6 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  53.94 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  53.11 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  53.94 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  54.77 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  54.77 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  54.36 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  56.02 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  52.28 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  52.28 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  54.77 
 
 		 301 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  56.43 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  27.5 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  52.22 
 
 		 91 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  32.31 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838292 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27416  predicted protein  27.56 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27489  predicted protein  27.56 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  24.03 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  28.3 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>