53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4825 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  67.77 
 
 
244 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  68.18 
 
 
242 aa  327  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  67.36 
 
 
242 aa  323  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  65.98 
 
 
242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  65.29 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.62 
 
 
239 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  65.7 
 
 
239 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.44 
 
 
243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.92 
 
 
242 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.22 
 
 
236 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  58.09 
 
 
244 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  63.22 
 
 
234 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  60.42 
 
 
238 aa  270  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  57.92 
 
 
245 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  56.15 
 
 
241 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  58.16 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  57.32 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  56.43 
 
 
245 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.74 
 
 
241 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.74 
 
 
241 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  55.23 
 
 
242 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  58.16 
 
 
241 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  57.14 
 
 
238 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  57.74 
 
 
236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  56.07 
 
 
259 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  56.07 
 
 
242 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  54.36 
 
 
240 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.17 
 
 
245 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  56.07 
 
 
242 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  57.98 
 
 
238 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  56.72 
 
 
238 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.9 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.9 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  56.9 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  55.23 
 
 
232 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  54.17 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  52.28 
 
 
296 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  52.92 
 
 
234 aa  234  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  54.36 
 
 
301 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  53.53 
 
 
303 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  50 
 
 
236 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  53.94 
 
 
284 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  26.97 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  52.33 
 
 
91 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  28.9 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0838292 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  22.81 
 
 
231 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27416  predicted protein  27.64 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27489  predicted protein  27.64 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  30.11 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  28.68 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06024  hypothetical protein  25.23 
 
 
201 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.146388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>