53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4403 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
236 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  79.24 
 
 
236 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  76.27 
 
 
236 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  71.06 
 
 
234 aa  359  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  70.76 
 
 
232 aa  347  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.42 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.49 
 
 
241 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.07 
 
 
241 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  63.9 
 
 
241 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  60.74 
 
 
242 aa  297  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.66 
 
 
241 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.66 
 
 
292 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  62.66 
 
 
241 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  62.03 
 
 
238 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  62.45 
 
 
238 aa  294  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  61.02 
 
 
238 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  62.13 
 
 
234 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.24 
 
 
239 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  58.26 
 
 
259 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  58.26 
 
 
242 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  57.85 
 
 
242 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  61.18 
 
 
238 aa  284  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  58.26 
 
 
245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  57.85 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  57.5 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  60.25 
 
 
241 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  59.66 
 
 
241 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  58.02 
 
 
244 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  57.92 
 
 
242 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  57.5 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.85 
 
 
242 aa  272  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  56.25 
 
 
244 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  57.74 
 
 
240 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.72 
 
 
245 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  58.82 
 
 
239 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  57.63 
 
 
236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.36 
 
 
243 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  55.19 
 
 
242 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  53.72 
 
 
303 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.12 
 
 
236 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  53.5 
 
 
301 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  54.17 
 
 
243 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  54.13 
 
 
284 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  50.83 
 
 
296 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  26.83 
 
 
266 aa  92  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  50 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  29.27 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  25.45 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0838292 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15097  predicted protein  23.58 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  25.94 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  24.77 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  28.15 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  23.37 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>