37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3267 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  65.67 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0385  glutathione S-transferase-like protein  53.23 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35431  predicted protein  32.57 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.501778 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37658  predicted protein  30.7 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6097  Glutathione S-transferase domain protein  41.67 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0287375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  26.64 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  27.1 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  24.77 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7734  predicted protein  26.11 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645072  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  27.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  25.73 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  25 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  23.36 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  27.56 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  27.4 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  25 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2973  glutathione S-transferase-like  27.32 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00286843  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  26.06 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  25.7 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  23.53 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.79 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  26.63 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.66 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  28.35 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.08 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 241 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  28.57 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>