29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0385 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0385  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  55.39 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  53.23 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35431  predicted protein  30.41 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.501778 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37658  predicted protein  29.46 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  23.74 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6097  Glutathione S-transferase domain protein  30.93 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0287375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  24.35 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  27.53 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  24.55 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1174  Glutathione S-transferase domain protein  28.65 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  24.2 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  30.68 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  26.02 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  24.34 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  29.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  26.05 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  27.67 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 		 220 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  24.75 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  27.6 
 
 		 219 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.8 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  23.6 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.47 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7734  predicted protein  21.11 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  26.02 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  29.67 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>