50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3003 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3003  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3350  Glutathione S-transferase domain  95.8 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3070  glutathione S-transferase protein  88.61 
 
 		 238 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4636  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.49 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4403  Glutathione S-transferase domain  62.03 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2137  glutathione S-transferase-like protein  63.75 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  0.0475194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5488  putative glutathione S-transferase P subunit  62.71 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.42 
 
 		 241 aa  290  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.42 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3767  glutathione S-transferase-like protein  61.18 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1703  glutathione S-transferase-like  62.45 
 
 		 236 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4421  glutathione S-transferase-like  61.25 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3582  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.25 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3946  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.25 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1528  glutathione S-transferase-like  60.76 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0987  glutathione S-transferase P subunit  57.68 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1868  glutathione S-transferase P subunit  57.68 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1960  glutathione S-transferase protein  57.68 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0500296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0400  glutathione S-transferase P subunit  57.68 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2282  Glutathione S-transferase domain  57.68 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1976  putative glutathione S-transferase  57.68 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.311102  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5874  Glutathione S-transferase domain  57.98 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4316  glutathione S-transferase-like protein  59.92 
 
 		 238 aa  268  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4422  glutathione S-transferase-like protein  59.92 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4052  glutathione S-transferase-like protein  59.92 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0105459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4534  glutathione S-transferase-like protein  58.51 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1257  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.6 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6782  Glutathione S-transferase domain protein  56.9 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4406  putative glutathione S-transferase protein  56.96 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1963  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.55 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4825  glutathione S-transferase-like protein  56.72 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3973  glutathione S-transferase-like protein  56.3 
 
 		 303 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2420  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.77 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3509  glutathione S-transferase-like protein  55.04 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0622574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3007  glutathione S-transferase-like  53.28 
 
 		 244 aa  248  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  0.212424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3112  putative glutathione S-transferase P subunit  53.72 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3147  glutathione transferase  56.54 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.169475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0121  glutathione S-transferase-like protein  52.94 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2383  Glutathione S-transferase domain protein  58.65 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6723  Glutathione S-transferase domain protein  57.32 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3832  glutathione S-transferase-like protein  56.3 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3138  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.58 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3895  glutathione S-transferase-like protein  56.72 
 
 		 284 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6528  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.43 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  0.0527132 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32813  predicted protein  27.05 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0694716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02156  glutathione transferase  50 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2308  hypothetical protein  27.1 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  26.64 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27416  predicted protein  28.81 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27489  predicted protein  28.81 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>