54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0762 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0762  putative flagellar protein FliS  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0868  flagellar protein FliS  68.22 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0709  putative flagellar protein FliS  57.14 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3161  putative flagellar protein fliS  54.62 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  0.163853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  26.05 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  28.93 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  33.9 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  30.16 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  27.91 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  31.09 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  28.79 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  27.27 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  29.91 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  28.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  26.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  26.61 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  28.8 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  27.88 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  30.59 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  27.05 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  27.52 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  26.45 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  23.97 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  25.83 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  25 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  26.45 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  27.06 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2536  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.546629  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  31.51 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  28.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  25 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  27.45 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  30.59 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  28.24 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  30.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  25.62 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  27.06 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  30 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  28 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  29.27 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  26.47 
 
 		 130 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  26.47 
 
 		 130 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  26.98 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  28.21 
 
 		 168 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  24.79 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  21.21 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  28.24 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  28.24 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  23.48 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2921  flagellar protein FliS  32.73 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  25.22 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  25.53 
 
 		 142 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>