32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0709 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0709  putative flagellar protein FliS  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3161  putative flagellar protein fliS  65.12 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  0.163853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0868  flagellar protein FliS  62.5 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0762  putative flagellar protein FliS  57.14 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  38.14 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  31.67 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  24.32 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  26 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  28.32 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  25.66 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  25.66 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  29.7 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  29.7 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  26.13 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  25.98 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  24 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  25.6 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  25 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  26.89 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  28.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  27.48 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  32.52 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  26.88 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  27.68 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  26.72 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  24.8 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  23.2 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  24 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  24.8 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  24 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  28.93 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  21.5 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>