21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3161 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3161  putative flagellar protein fliS  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  0.163853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0709  putative flagellar protein FliS  65.12 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0762  putative flagellar protein FliS  54.62 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0868  flagellar protein FliS  59.13 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  29.23 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  30.97 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  34.43 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  32.56 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  21.62 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  23.89 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  26.21 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  26.92 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  26.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  28.35 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  25.96 
 
 		 137 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0625  flagellar protein FliS  28.44 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  23.33 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  22.22 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  24.19 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>