34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1428 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  920    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  90.77 
 
 		 457 aa  840    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  65.11 
 
 		 460 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  64.67 
 
 		 460 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  64.4 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  65.04 
 
 		 468 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  67.6 
 
 		 468 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  64.6 
 
 		 468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  65.72 
 
 		 465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  64.62 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  67.14 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  64.34 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  63.19 
 
 		 466 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  65.83 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  65.87 
 
 		 470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  64.57 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  65.18 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  64.47 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  61.24 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  49.11 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  53.94 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  48.44 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  37.99 
 
 		 666 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  37.08 
 
 		 494 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  36.85 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  36.38 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  37.44 
 
 		 468 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  37.79 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  33.59 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  30.84 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  27.75 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  26.46 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  26.46 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  25.89 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>