34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  100 
 
 
454 aa  908    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  61.49 
 
 
460 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  62.1 
 
 
460 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  61.24 
 
 
455 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  62.18 
 
 
457 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  56.75 
 
 
466 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  56.92 
 
 
464 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  58.51 
 
 
465 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  59.15 
 
 
468 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  57.53 
 
 
464 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  57.44 
 
 
466 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  55.97 
 
 
470 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  58.69 
 
 
468 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  58.33 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  58.22 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  58.22 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  56.81 
 
 
466 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  57.81 
 
 
468 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  56.25 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  46.19 
 
 
451 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  48.33 
 
 
451 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  46.81 
 
 
460 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  36.38 
 
 
666 aa  286  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  37.16 
 
 
494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  38.63 
 
 
468 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  37.16 
 
 
494 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  36.67 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  38.05 
 
 
475 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  34.79 
 
 
409 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  30.62 
 
 
446 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  27.54 
 
 
455 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  27.54 
 
 
455 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  26.87 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  26.9 
 
 
461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>