34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2399 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  939    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  75.61 
 
 
466 aa  676    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  74.17 
 
 
466 aa  658    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  87.55 
 
 
467 aa  802    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  77.7 
 
 
470 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  97.44 
 
 
468 aa  890    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  75.27 
 
 
468 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  75.44 
 
 
464 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  97.65 
 
 
468 aa  891    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  76.94 
 
 
465 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  75.61 
 
 
464 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  81.74 
 
 
466 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  75.83 
 
 
464 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  76.89 
 
 
465 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  65.04 
 
 
455 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  64.69 
 
 
457 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  62.44 
 
 
460 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  62.22 
 
 
460 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  58.69 
 
 
454 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  52.47 
 
 
451 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  50.66 
 
 
451 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  54.16 
 
 
460 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  41.45 
 
 
666 aa  326  5e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  37.27 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  40.5 
 
 
468 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  40.24 
 
 
475 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  41.35 
 
 
494 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  38.86 
 
 
493 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  35.46 
 
 
446 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  37.4 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  31.07 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  28.5 
 
 
455 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  28.5 
 
 
455 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  27.79 
 
 
460 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>