34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2954 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  924    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  75 
 
 		 460 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  92.24 
 
 		 451 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  54.21 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  51.01 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  52.82 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  53.74 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  54.59 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  53.18 
 
 		 464 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  53.36 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  49.11 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  51.95 
 
 		 466 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  53.41 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  49.32 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  50.11 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  52.56 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  52.47 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  53.08 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  52.47 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  52 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  51.54 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  46.19 
 
 		 454 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  39.86 
 
 		 666 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  38.37 
 
 		 494 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  37.76 
 
 		 494 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  41.35 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  40.5 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  38 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  36.03 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  33.17 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  27.25 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  26.54 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>