34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4184 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  76.39 
 
 		 468 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  81.24 
 
 		 466 aa  753    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  82.25 
 
 		 466 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  75.11 
 
 		 467 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  74.78 
 
 		 470 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  76.01 
 
 		 468 aa  658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  91.88 
 
 		 464 aa  867    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  75.28 
 
 		 468 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  88.71 
 
 		 465 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  91.88 
 
 		 464 aa  863    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  77.2 
 
 		 466 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  92.31 
 
 		 464 aa  842    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  90.32 
 
 		 465 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  64.17 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  64.47 
 
 		 455 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  64.19 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  64.19 
 
 		 460 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  57.81 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  53.51 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  53.36 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  54.08 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  41.16 
 
 		 666 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  42.51 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  41.42 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  40.41 
 
 		 475 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  42.51 
 
 		 494 aa  299  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  40 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  35.08 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  36.71 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  30.5 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  27.86 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  27.86 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  27.68 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>