34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1058 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  938    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  74.5 
 
 
460 aa  712    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  938    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  30.71 
 
 
446 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  28.87 
 
 
470 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  27.45 
 
 
457 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  27.01 
 
 
466 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  28.43 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  26.99 
 
 
409 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  28.33 
 
 
465 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  28.17 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  27.4 
 
 
464 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  28.77 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  27.69 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  26.96 
 
 
468 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  27.16 
 
 
464 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  25.89 
 
 
460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  26.14 
 
 
460 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  26.01 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  27.93 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  26.46 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  26.81 
 
 
454 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  25.81 
 
 
666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  27.25 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  27.32 
 
 
468 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  27.55 
 
 
468 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  26.02 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  25.51 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  25.28 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  26.37 
 
 
467 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  26.84 
 
 
468 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  23.52 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  22.52 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>