34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0688 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  87.55 
 
 		 468 aa  809    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  71.79 
 
 		 466 aa  665    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  73.77 
 
 		 466 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  939    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  73.88 
 
 		 470 aa  681    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  86.91 
 
 		 468 aa  800    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  74.67 
 
 		 468 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  73.75 
 
 		 464 aa  677    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  87.12 
 
 		 468 aa  804    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  73.99 
 
 		 465 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  75 
 
 		 464 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  82.41 
 
 		 466 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  74.56 
 
 		 464 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  73.82 
 
 		 465 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  64.04 
 
 		 455 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  63.16 
 
 		 457 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  62.72 
 
 		 460 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  64.08 
 
 		 460 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  55.56 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  51.54 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  50.66 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  53.71 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  41.67 
 
 		 666 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  39.74 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  40.56 
 
 		 494 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  40.49 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  41.26 
 
 		 493 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  40.33 
 
 		 494 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  35.87 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  36.6 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  29.84 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  26.56 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  27.55 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  27.55 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>