34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1620 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  75.61 
 
 		 468 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  941    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  88.2 
 
 		 466 aa  817    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  76.96 
 
 		 467 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  73.09 
 
 		 470 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  74.5 
 
 		 468 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  81.24 
 
 		 468 aa  732    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  81.51 
 
 		 464 aa  763    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  74.72 
 
 		 468 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  82.11 
 
 		 465 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  81.08 
 
 		 464 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  75.94 
 
 		 466 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  81.72 
 
 		 464 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  79.43 
 
 		 465 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  64.57 
 
 		 457 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  64.4 
 
 		 455 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  62.64 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  63.09 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  56.75 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  51.95 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  53.21 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  51.65 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  39.86 
 
 		 666 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  40.97 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  41.26 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  41.38 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  41.01 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  41.02 
 
 		 475 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  35.08 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  35.52 
 
 		 409 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  29.28 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  28.21 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>