34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2864 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  77.7 
 
 
468 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  73.09 
 
 
466 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  71.61 
 
 
466 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  73.88 
 
 
467 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  954    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  74.63 
 
 
468 aa  680    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  74.78 
 
 
468 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  74.4 
 
 
464 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  76.38 
 
 
468 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  75.11 
 
 
465 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  74.56 
 
 
464 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  76.62 
 
 
466 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  75.05 
 
 
464 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  74.6 
 
 
465 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  65.49 
 
 
457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  65.87 
 
 
455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  60.79 
 
 
460 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  60.48 
 
 
460 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  55.97 
 
 
454 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  53.81 
 
 
460 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  53.08 
 
 
451 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  52.84 
 
 
451 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  40.87 
 
 
666 aa  329  8e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  39.25 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  38.72 
 
 
494 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  38.31 
 
 
468 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  37.75 
 
 
494 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  37.86 
 
 
493 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  34.59 
 
 
446 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  36.04 
 
 
409 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  30.14 
 
 
455 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  30.14 
 
 
455 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  31.25 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  27.48 
 
 
460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>