34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4163 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  97.57 
 
 		 494 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  93.52 
 
 		 493 aa  897    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1011    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  63.49 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  63.95 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  42.55 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  40.97 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  42.45 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  41.35 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  39.13 
 
 		 666 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  39.49 
 
 		 451 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  43.17 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  39.49 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  38.37 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  39.02 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  41.16 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  42.51 
 
 		 468 aa  303  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  40.87 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  37.08 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  38.22 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  40.51 
 
 		 466 aa  295  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  41.11 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  38.53 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  40.56 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  41.11 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  35.04 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  38.72 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  37.16 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  33.02 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  30.96 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  27.9 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  25.51 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  25.51 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>