34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3027 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  75.45 
 
 		 451 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  932    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  75.23 
 
 		 451 aa  690    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  55.56 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  56.43 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  55.13 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  54.65 
 
 		 464 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  53.94 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  53.01 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  52.55 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  56.43 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  54.08 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  55.1 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  53.81 
 
 		 470 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  51.65 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  55.06 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  50.89 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  54.27 
 
 		 466 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  54.63 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  54.16 
 
 		 468 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  53.44 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  46.81 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  39.69 
 
 		 666 aa  322  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  35.04 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  39.16 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  39.25 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  38.5 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  36.52 
 
 		 493 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  35.73 
 
 		 409 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  34.75 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  28.26 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  28.26 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  29.16 
 
 		 461 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  26.51 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>