34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0680 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3700  hypothetical protein  78.49 
 
 		 468 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  967    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4163  hypothetical protein  63.95 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0350  hypothetical protein  63.95 
 
 		 494 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4073  hypothetical protein  64.42 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3429  hypothetical protein  41.78 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3332  hypothetical protein  41.6 
 
 		 451 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1179  hypothetical protein  42.79 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1774  hypothetical protein  41.33 
 
 		 666 aa  325  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0983055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1251  hypothetical protein  40.45 
 
 		 464 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2954  hypothetical protein  41.35 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0943524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1620  hypothetical protein  41.02 
 
 		 466 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1393  hypothetical protein  43.51 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0430  hypothetical protein  41.5 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2358  hypothetical protein  40.68 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000347039  unclonable  0.000000192089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0688  hypothetical protein  40.94 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.635205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4184  hypothetical protein  40.41 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2399  hypothetical protein  40.24 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.926844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0848  hypothetical protein  38.2 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0943  hypothetical protein  39.77 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3027  hypothetical protein  39.16 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4521  putative integral membrane protein  38.05 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2181  hypothetical protein  39.76 
 
 		 468 aa  296  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60000  hypothetical protein  38.16 
 
 		 460 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.891513  hitchhiker  0.0000000143793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2864  hypothetical protein  39.25 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0489  hypothetical protein  38.44 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1428  hypothetical protein  37.3 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36360  conserved hypothetical, protein  38.05 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3923  hypothetical protein  33.89 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0652  hypothetical protein  31.68 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2752  hypothetical protein  28.95 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0961114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1020  hypothetical protein  24.23 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1058  hypothetical protein  24.23 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2394  hypothetical protein  24.06 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>