157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3080 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  94.85 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  93.56 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  87.12 
 
 		 230 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  86.7 
 
 		 230 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  82.13 
 
 		 238 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  81.86 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  80.17 
 
 		 240 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  84.35 
 
 		 229 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  78.79 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  76.67 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  76.39 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  75.97 
 
 		 238 aa  363  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  74.47 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  75.83 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  75.42 
 
 		 245 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  75.97 
 
 		 240 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  76.52 
 
 		 240 aa  362  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  76.39 
 
 		 240 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  74.68 
 
 		 245 aa  359  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  72.57 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  72.57 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  75.74 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  74.26 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  74.26 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  73.39 
 
 		 234 aa  353  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  73.71 
 
 		 237 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  74.57 
 
 		 246 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  73.48 
 
 		 240 aa  350  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  72.65 
 
 		 234 aa  348  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  73.39 
 
 		 236 aa  348  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  73.71 
 
 		 238 aa  347  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  74.15 
 
 		 238 aa  347  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  74.89 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  71.67 
 
 		 237 aa  344  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  69.07 
 
 		 244 aa  343  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  71.63 
 
 		 236 aa  343  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  72.1 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  71.24 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  71.67 
 
 		 243 aa  340  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  74.79 
 
 		 244 aa  339  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  72.37 
 
 		 239 aa  338  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  72.53 
 
 		 245 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  72.37 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  70.67 
 
 		 254 aa  328  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  68.94 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  68.94 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  70.64 
 
 		 241 aa  327  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  67.23 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  74.64 
 
 		 241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  76.38 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  66.12 
 
 		 249 aa  325  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  67.97 
 
 		 232 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  72.81 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  65.96 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  70.13 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  68 
 
 		 254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  67.41 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  69.51 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  73.36 
 
 		 237 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  69.06 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  73.06 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  70 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  68.16 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  72.82 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  68.16 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  67.56 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 		 248 aa  309  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  67.71 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  65.8 
 
 		 231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  65.92 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  65.75 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  64.71 
 
 		 248 aa  298  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  66.82 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  66.82 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  66.52 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  64.57 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  67 
 
 		 216 aa  288  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  66.51 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  67.79 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  58.88 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  57.51 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  56.49 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  72.97 
 
 		 82 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 		 182 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.28 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 181 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.63 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  25.64 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  27.86 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  29.51 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>