171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5053 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  78.78 
 
 		 247 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  75.82 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  72.24 
 
 		 251 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  72.2 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  68.64 
 
 		 238 aa  309  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  73.33 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  73.71 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  67.58 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  72.86 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  67.12 
 
 		 237 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  67.89 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  67.45 
 
 		 238 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  67.57 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  63.68 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  73.98 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  63.68 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  72.31 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  68.25 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  62.45 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  66.21 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  65.75 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  71.79 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  65.75 
 
 		 233 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  66.37 
 
 		 246 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  66.37 
 
 		 246 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  66.36 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  65.62 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  71.57 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  66.22 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  61.86 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  61.86 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  65.75 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  66.82 
 
 		 230 aa  295  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  69.65 
 
 		 248 aa  295  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  64.22 
 
 		 245 aa  294  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  70.92 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  71.28 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  65.91 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  66.97 
 
 		 246 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  70.2 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  64.84 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  70.77 
 
 		 240 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  62.93 
 
 		 237 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  66.36 
 
 		 229 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  72.31 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  71.65 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  68.84 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  62.39 
 
 		 238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  63.39 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  67.68 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  65.6 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  63.39 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  63.76 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  69.39 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  69.39 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  68.81 
 
 		 236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  62.95 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  68.88 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  62.95 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  62.5 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  68 
 
 		 215 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  68 
 
 		 215 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  62.67 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  62.05 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  61.33 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  65.12 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  67 
 
 		 211 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  59.11 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  66.5 
 
 		 216 aa  274  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  67.66 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  62.22 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  63.03 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  61.54 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  56.44 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106872 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  51.11 
 
 		 303 aa  234  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  55.56 
 
 		 193 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  59.43 
 
 		 146 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 		 181 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 182 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  58.9 
 
 		 82 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 		 184 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  27.16 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3268  NADPH-dependent FMN reductase  24.58 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.73404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  25.49 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  23.7 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  25.93 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3042  NADPH-dependent FMN reductase  23.46 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1148  NADPH-dependent FMN reductase  24.86 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  28.77 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>