158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3339 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  80.51 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  76.37 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  79.49 
 
 		 237 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  76.5 
 
 		 238 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  79.49 
 
 		 237 aa  357  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  73.28 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  74.03 
 
 		 234 aa  352  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  72.84 
 
 		 240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  72.96 
 
 		 240 aa  352  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  73.93 
 
 		 240 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  72.34 
 
 		 245 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  70.94 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  72.1 
 
 		 245 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  71.49 
 
 		 245 aa  346  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  72.53 
 
 		 237 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  70.26 
 
 		 234 aa  345  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  72.17 
 
 		 240 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  71.61 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  72.17 
 
 		 240 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  71.37 
 
 		 240 aa  340  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  70.39 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  71.55 
 
 		 238 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  72.05 
 
 		 243 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  71.3 
 
 		 238 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  75 
 
 		 232 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  69.83 
 
 		 246 aa  338  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  71.43 
 
 		 245 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  71.3 
 
 		 246 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  70.21 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  71.3 
 
 		 246 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  70.21 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  68.64 
 
 		 246 aa  334  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  68.64 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  69.36 
 
 		 233 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  71.56 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  68.67 
 
 		 238 aa  330  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  68.51 
 
 		 233 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  68.94 
 
 		 233 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  68.67 
 
 		 230 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  70.85 
 
 		 254 aa  327  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  68.67 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  69.79 
 
 		 238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  69.13 
 
 		 241 aa  324  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  67.09 
 
 		 237 aa  324  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  66.81 
 
 		 241 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  70.48 
 
 		 236 aa  324  9e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  70.95 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  68.26 
 
 		 236 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  71.49 
 
 		 247 aa  318  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  70.14 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  70.78 
 
 		 255 aa  317  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  68.75 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  66.53 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  68.75 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  64.78 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  66.52 
 
 		 229 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  68.92 
 
 		 255 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  68.95 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  67.58 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  68.18 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  73.47 
 
 		 248 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  61.97 
 
 		 263 aa  305  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  66.67 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  70.1 
 
 		 232 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  60.43 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  60.34 
 
 		 249 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  67.58 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  65.24 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  61.86 
 
 		 251 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  69.5 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  68.75 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  68.22 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  63.8 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  65.24 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  65.24 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  70.92 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  67.16 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  64.18 
 
 		 216 aa  276  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  60.7 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  57.59 
 
 		 193 aa  231  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  71.15 
 
 		 146 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  66.22 
 
 		 82 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 		 182 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 178 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 178 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  30.51 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 		 181 aa  88.2  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  25.77 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  23.73 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  27.78 
 
 		 178 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  27.89 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  25.97 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  24.54 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2060  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  27.14 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>