176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1927 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  84.23 
 
 
240 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  81.2 
 
 
238 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  81.43 
 
 
233 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  81.86 
 
 
233 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  81.01 
 
 
233 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  79.32 
 
 
230 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  79.75 
 
 
230 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  80.77 
 
 
229 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  77.92 
 
 
244 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  75.54 
 
 
240 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  75.11 
 
 
240 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  74.58 
 
 
240 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  73.22 
 
 
245 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  74.79 
 
 
246 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  73.95 
 
 
245 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  78.03 
 
 
245 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  72.27 
 
 
246 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  72.27 
 
 
246 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  74.68 
 
 
238 aa  363  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  75.11 
 
 
234 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  72.15 
 
 
245 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  71.97 
 
 
240 aa  361  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  70.04 
 
 
237 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  70.04 
 
 
237 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  73.53 
 
 
240 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  70.95 
 
 
246 aa  358  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  72.1 
 
 
240 aa  355  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  72.1 
 
 
237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  70.89 
 
 
244 aa  353  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  73.08 
 
 
238 aa  352  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  72.1 
 
 
238 aa  351  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  72.53 
 
 
238 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  71.75 
 
 
254 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  70.46 
 
 
237 aa  347  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  69.79 
 
 
234 aa  347  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  71.31 
 
 
236 aa  345  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  70.39 
 
 
240 aa  344  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  69.96 
 
 
240 aa  341  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  74.88 
 
 
236 aa  340  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  69.96 
 
 
243 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  69.1 
 
 
241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  69.96 
 
 
245 aa  334  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  70.22 
 
 
254 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  68.28 
 
 
254 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  69.07 
 
 
239 aa  329  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  70.39 
 
 
244 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  72.52 
 
 
238 aa  329  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  65.27 
 
 
249 aa  325  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  69.51 
 
 
232 aa  325  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  67.53 
 
 
232 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  68.7 
 
 
237 aa  324  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  66.81 
 
 
235 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  66.81 
 
 
235 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  65.96 
 
 
248 aa  321  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  67.39 
 
 
248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  69.23 
 
 
255 aa  318  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  69.33 
 
 
247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  68.09 
 
 
241 aa  318  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  65.38 
 
 
263 aa  317  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  67.09 
 
 
237 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  68 
 
 
250 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  67.26 
 
 
248 aa  315  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  67.73 
 
 
248 aa  315  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  66.52 
 
 
248 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  68.04 
 
 
246 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  68.33 
 
 
255 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  69.09 
 
 
237 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  64.76 
 
 
248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  64.35 
 
 
248 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  66.52 
 
 
251 aa  301  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  64.94 
 
 
231 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  63.64 
 
 
247 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  62.45 
 
 
251 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  63.71 
 
 
248 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  68.5 
 
 
211 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  65.24 
 
 
215 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  65.24 
 
 
215 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  65.62 
 
 
251 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 
216 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  58.37 
 
 
303 aa  258  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  58.03 
 
 
193 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  55.81 
 
 
146 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  70.27 
 
 
82 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  32.02 
 
 
188 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.83 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
178 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.73 
 
 
178 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.32 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  27.39 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  30.92 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  26.37 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  24.18 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  27.13 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  25.56 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3711  NADPH-dependent FMN reductase  26.09 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0350299  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
195 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>