179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1960 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  78.86 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  78.05 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  79.03 
 
 		 245 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  79.59 
 
 		 243 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  77.24 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  79.25 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  77.59 
 
 		 240 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  80.59 
 
 		 240 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  77.64 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  77.18 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  79.57 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  77.55 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  77.55 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  80.43 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  80.59 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  76.76 
 
 		 240 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  78.48 
 
 		 238 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  76.17 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  80.83 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  74.89 
 
 		 238 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  76.6 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  74.79 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  74.04 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  74.58 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  73.19 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  72.5 
 
 		 244 aa  364  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  74.47 
 
 		 233 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  73.19 
 
 		 233 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  74.35 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  76.82 
 
 		 237 aa  361  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  72.69 
 
 		 239 aa  360  9e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  74.26 
 
 		 236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  73.19 
 
 		 234 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  73.8 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  70.78 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  73.48 
 
 		 237 aa  351  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  73.48 
 
 		 237 aa  351  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  70.39 
 
 		 244 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  75.83 
 
 		 236 aa  350  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  72.29 
 
 		 240 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  72.34 
 
 		 230 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  76.13 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  73.84 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  71.49 
 
 		 230 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  71.79 
 
 		 229 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  69.58 
 
 		 241 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  67.93 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  70.89 
 
 		 237 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  78.11 
 
 		 232 aa  335  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  68.64 
 
 		 235 aa  334  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  68.64 
 
 		 235 aa  334  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  68.38 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  72.52 
 
 		 250 aa  329  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  72.27 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  69.96 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  65.4 
 
 		 232 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  71.82 
 
 		 248 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  69.53 
 
 		 247 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  71.36 
 
 		 255 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  70.91 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  67.87 
 
 		 254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  68.53 
 
 		 237 aa  318  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  70.35 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  68.02 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  71.36 
 
 		 248 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  69.23 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  70.51 
 
 		 237 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  68.95 
 
 		 248 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  76.53 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  72.86 
 
 		 251 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  71.92 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  62.87 
 
 		 231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  70.67 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  69.95 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  67.96 
 
 		 211 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  65 
 
 		 246 aa  295  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  65.38 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  65.38 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  67.51 
 
 		 216 aa  282  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  61.14 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  57.87 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  60.63 
 
 		 146 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  68.92 
 
 		 82 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 		 182 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  32.16 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 		 181 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 178 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 178 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.68 
 
 		 181 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  27.56 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  26.97 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  24.72 
 
 		 193 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  26.35 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  29.25 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  29.25 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  28.57 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2310  azoreductase  31.53 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.702721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>