83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1104 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  82.93 
 
 
248 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  82.93 
 
 
255 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  81.71 
 
 
255 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  80.49 
 
 
247 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  80.49 
 
 
248 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  79.27 
 
 
248 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  79.27 
 
 
248 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  79.27 
 
 
250 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  79.27 
 
 
248 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  76 
 
 
238 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  66.25 
 
 
254 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  72.97 
 
 
237 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  74.32 
 
 
230 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  70.51 
 
 
238 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  72.97 
 
 
238 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  71.62 
 
 
240 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  72.97 
 
 
233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  67.95 
 
 
245 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  72.97 
 
 
230 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  65.38 
 
 
254 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  71.62 
 
 
245 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  69.51 
 
 
234 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  67.57 
 
 
241 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  68.92 
 
 
240 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
240 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
243 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  72.97 
 
 
244 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  66.22 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 
245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
238 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  67.57 
 
 
238 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  68.49 
 
 
246 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  68.92 
 
 
240 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 
240 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  64.2 
 
 
234 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  70.27 
 
 
241 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  68.92 
 
 
233 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  67.57 
 
 
246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  67.57 
 
 
246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  67.57 
 
 
240 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  67.57 
 
 
237 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  67.57 
 
 
240 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  65.38 
 
 
240 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  68.92 
 
 
246 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  64.1 
 
 
238 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  65.38 
 
 
240 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  68.92 
 
 
246 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  66.22 
 
 
235 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  66.67 
 
 
251 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  62.82 
 
 
237 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  62.82 
 
 
237 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  66.22 
 
 
235 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  61.73 
 
 
245 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  66.22 
 
 
251 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  66.22 
 
 
233 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  62.82 
 
 
241 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  64.86 
 
 
237 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  67.12 
 
 
237 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  64.86 
 
 
248 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  63.51 
 
 
248 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  66.22 
 
 
244 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  58.97 
 
 
236 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  63.01 
 
 
247 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  60.26 
 
 
236 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  60 
 
 
244 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  57.69 
 
 
232 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  62.96 
 
 
229 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  61.84 
 
 
211 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  65.71 
 
 
237 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  60 
 
 
216 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  57.69 
 
 
248 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  58.11 
 
 
231 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  58.9 
 
 
251 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  56.41 
 
 
263 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  56.76 
 
 
239 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  57.53 
 
 
215 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  57.53 
 
 
215 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  53.66 
 
 
249 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  47.5 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  48.72 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>