163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2241 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  84.23 
 
 
247 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  77.46 
 
 
251 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  75.82 
 
 
251 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  72.36 
 
 
251 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  72.57 
 
 
238 aa  331  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  76.35 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  70.62 
 
 
238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  68.3 
 
 
238 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  70.67 
 
 
246 aa  301  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  68.78 
 
 
233 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  72.96 
 
 
234 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  71.86 
 
 
254 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  73.1 
 
 
245 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  64.71 
 
 
233 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  67.87 
 
 
233 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  64.05 
 
 
240 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  67.3 
 
 
236 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  73.47 
 
 
240 aa  297  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  67.57 
 
 
245 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  63.71 
 
 
241 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  69.23 
 
 
245 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  66.23 
 
 
240 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  65.77 
 
 
237 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  72.96 
 
 
240 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  72.08 
 
 
240 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  68.75 
 
 
235 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  68.75 
 
 
235 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  71.57 
 
 
240 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  71.57 
 
 
245 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  67.94 
 
 
245 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  72.08 
 
 
238 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  68.27 
 
 
240 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  66.97 
 
 
230 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  72.68 
 
 
234 aa  291  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  68.27 
 
 
240 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  62.83 
 
 
244 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  66.51 
 
 
244 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  68.27 
 
 
243 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  66.97 
 
 
230 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  71.79 
 
 
240 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  71.07 
 
 
237 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  67.79 
 
 
237 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  70.65 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  70.41 
 
 
246 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  70.41 
 
 
246 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 
255 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  70.77 
 
 
254 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  72.68 
 
 
255 aa  287  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  67.27 
 
 
229 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  65.64 
 
 
250 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  64.16 
 
 
239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  71.65 
 
 
248 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  71.65 
 
 
248 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  62.95 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  66.83 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  62.34 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  71.13 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  69.74 
 
 
254 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  71.13 
 
 
248 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  65.38 
 
 
241 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  70.1 
 
 
248 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  70.47 
 
 
246 aa  279  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 
215 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  66.67 
 
 
215 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  70.62 
 
 
247 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  66.51 
 
 
237 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  67.82 
 
 
236 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  65.87 
 
 
238 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  68.72 
 
 
211 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  65.14 
 
 
237 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  65.66 
 
 
232 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  67.88 
 
 
216 aa  272  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  62.2 
 
 
237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  62.2 
 
 
237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  57.32 
 
 
248 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  62.45 
 
 
244 aa  264  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  63.73 
 
 
249 aa  265  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  57.83 
 
 
263 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  61.62 
 
 
231 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106872 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  57.58 
 
 
303 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  57.89 
 
 
193 aa  231  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  63.73 
 
 
146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  64.86 
 
 
82 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
178 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  32.24 
 
 
178 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  33.9 
 
 
188 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 
182 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
181 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
184 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  27.62 
 
 
181 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  28.14 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3268  NADPH-dependent FMN reductase  27.42 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.73404  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3750  NADPH-dependent FMN reductase  25.79 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3357  NADPH-dependent FMN reductase  24.14 
 
 
193 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0315323  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1275  NADPH-dependent FMN reductase  27.1 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  27.39 
 
 
176 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  28.41 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  28.41 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>