192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3396 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3396  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03335  NADPH-dependent FMN reductase  75.76 
 
 
236 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3639  NADPH-dependent FMN reductase  76.19 
 
 
238 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5711  arsenical resistance protein ArsH  76.19 
 
 
245 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5598  NADPH-dependent FMN reductase  77.78 
 
 
240 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219969  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6327  arsenical resistance protein ArsH  78.22 
 
 
240 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0162337  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5670  arsenical resistance protein ArsH  74.79 
 
 
245 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563276  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6565  NADPH-dependent FMN reductase  75.64 
 
 
245 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4213  arsenical resistance protein ArsH  74.79 
 
 
240 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.256913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1960  arsenical resistance protein ArsH  72.5 
 
 
246 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0764364  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6299  arsenical resistance protein ArsH  75.32 
 
 
245 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.417394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3778  arsenical resistance protein ArsH, putative  73.48 
 
 
234 aa  359  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4963  NADPH-dependent FMN reductase  73 
 
 
246 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3197  NADPH-dependent FMN reductase  73 
 
 
246 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1141  arsenate resistance ArsH  69.14 
 
 
249 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1927  arsenical resistance protein ArsH, putative  70.89 
 
 
241 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329058  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5768  arsenical resistance protein ArsH  72.65 
 
 
240 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2585  NADPH-dependent FMN reductase  71.3 
 
 
246 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.181935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1520  NADPH-dependent FMN reductase  70.34 
 
 
240 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.85919  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5149  arsenical resistance protein ArsH  70.56 
 
 
238 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.135921  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1485  NADPH-dependent FMN reductase  70.56 
 
 
236 aa  348  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2314  arsenical resistance protein ArsH  70.56 
 
 
240 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4428  NADPH-dependent FMN reductase  71.24 
 
 
240 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2715  arsH protein  69.49 
 
 
233 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.74454  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0492  arsenical resistance protein ArsH  71 
 
 
240 aa  344  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2220  NADPH-dependent FMN reductase  70.43 
 
 
237 aa  344  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3080  arsenical resistance protein ArsH  69.07 
 
 
233 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3037  arsenate resistance ArsH  69.07 
 
 
233 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317607  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1284  NADPH-dependent FMN reductase  71.43 
 
 
243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1501  NADPH-dependent FMN reductase  74.41 
 
 
244 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2287  arsenical resistance protein ArsH  71 
 
 
238 aa  341  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563359  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0646  arsenical resistance protein ArsH  71 
 
 
245 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0455482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2397  NADPH-dependent FMN reductase  72.97 
 
 
229 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2961  arsenical resistance protein ArsH  73.93 
 
 
230 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3127  NADPH-dependent FMN reductase  69.03 
 
 
238 aa  337  8e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2857  arsenical resistance protein ArsH  73.68 
 
 
237 aa  337  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35080  putative arsenical resistance protein  72.99 
 
 
230 aa  337  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2478  arsenical resistance protein ArsH  73.68 
 
 
237 aa  337  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6091  putative NADPH-dependent FMN reductase  69.62 
 
 
237 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2419  arsenical resistance protein ArsH  70.14 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6068  arsenical resistance protein ArsH  69.96 
 
 
232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3197  arsenate resistance ArsH  67.39 
 
 
238 aa  334  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2103  NADPH-dependent FMN reductase  73.79 
 
 
239 aa  332  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288034  normal  0.440098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0104  arsenical resistance protein ArsH  66.81 
 
 
234 aa  331  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0878  arsenate resistance ArsH  66.67 
 
 
240 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00626  arsenical resistance protein ArsH  67.25 
 
 
241 aa  324  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3133  NADPH-dependent FMN reductase  70.95 
 
 
235 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61228  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3339  NADPH-dependent FMN reductase  70.95 
 
 
235 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1581  NADH oxidoreductase  68.51 
 
 
244 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1403  NADPH-dependent FMN reductase  65.93 
 
 
237 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55977  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1464  NADPH-dependent FMN reductase  62.3 
 
 
248 aa  321  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1789  arsenical resistance protein ArsH  69.16 
 
 
238 aa  320  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0450739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0210  arsenical resistance protein ArsH  65.78 
 
 
254 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.945383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2731  arsenical resistance protein, ArsH  64.6 
 
 
237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0328  NADPH-dependent FMN reductase  66.36 
 
 
254 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.997992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0954  NADPH-dependent FMN reductase  68.75 
 
 
263 aa  311  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0698  arsenical resistance protein ArsH  65.78 
 
 
250 aa  309  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1907  arsenical resistance protein ArsH  66.37 
 
 
248 aa  309  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0716  arsenical resistance protein ArsH  68.6 
 
 
232 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.075444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1390  NADPH-dependent FMN reductase  66.04 
 
 
237 aa  307  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.146081  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3863  arsenical resistance protein ArsH  66.22 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.152769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1045  arsenical resistance protein ArsH  65.92 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4172  arsenical resistance protein ArsH  71.94 
 
 
255 aa  304  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1377  arsenical resistance protein ArsH  65.22 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0523  arsenical resistance protein ArsH  63.88 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5053  arsenate resistance ArsH  66.67 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0301  putative arsinic resistance protein ArsH  64.68 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0954039  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1073  NADPH-dependent FMN reductase  65.07 
 
 
248 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3610  arsenical resistance protein ArsH  67.48 
 
 
211 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.404184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5720  arsenical resistance protein ArsH  64.52 
 
 
248 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4056  arsenical resistance protein ArsH  70.77 
 
 
248 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2537  NADPH-dependent FMN reductase  68.4 
 
 
247 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1978  arsenical resistance protein ArsH  64.65 
 
 
246 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.288528  normal  0.218001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2406  NADPH-dependent FMN reductase  70.2 
 
 
251 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2136  arsenical resistance protein ArsH  69.07 
 
 
251 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2241  arsenate resistance ArsH  66.51 
 
 
248 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192404  normal  0.613999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0591  arsenical resistance protein ArsH  64.53 
 
 
215 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0606  arsenical resistance protein ArsH  64.53 
 
 
215 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304956  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4254  NADPH-dependent FMN reductase  65.7 
 
 
231 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3362  arsenical resistance protein ArsH  64.47 
 
 
216 aa  278  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10571  arsenic resistance protein ArsH (AFU_orthologue; AFUA_5G15030)  58.38 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6554  predicted protein  55.44 
 
 
193 aa  227  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5680  NADPH-dependent FMN reductase  57.6 
 
 
146 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1104  arsenical resistance protein ArsH  60 
 
 
82 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3596  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0041425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 
188 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
181 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2460  NADPH-dependent FMN reductase  30.9 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.345085  normal  0.908129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5221  NADPH-dependent FMN reductase  28.03 
 
 
181 aa  82  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.681461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  28.66 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3252  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  27.43 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  34.95 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3932  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
198 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
194 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  25.14 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>