43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2015 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  100 
 
 		 335 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  95.45 
 
 		 331 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  93.93 
 
 		 331 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  86.04 
 
 		 329 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  69.06 
 
 		 308 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  54.35 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  51.72 
 
 		 318 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  44.98 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  44.98 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  45.45 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  42.07 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  43.89 
 
 		 306 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  42.24 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  43.87 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  43.56 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  42.39 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  41.3 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  41.3 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  42.07 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  41.37 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  43.41 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  39.75 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  40.91 
 
 		 298 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  43.33 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  40.19 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  41.88 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  41.9 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  41.03 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  42.17 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  40.76 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  40.76 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  39.94 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  38.19 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  38.48 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  39.35 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  37.54 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  38.27 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  38.08 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  36.19 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  35.78 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  36.22 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  39.16 
 
 		 158 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  37.61 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>