43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2729 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  100 
 
 
331 aa  673    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  51.24 
 
 
350 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  50.47 
 
 
335 aa  330  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  51.75 
 
 
340 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  45.15 
 
 
322 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  45.83 
 
 
298 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  42.21 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  38.76 
 
 
300 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  38.76 
 
 
300 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  39.05 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  38.29 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  39.09 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  40.34 
 
 
306 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  41.38 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  39.94 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  39.37 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  35.87 
 
 
331 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  35.87 
 
 
331 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  36.19 
 
 
335 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  37.62 
 
 
328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  38.73 
 
 
302 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  36.1 
 
 
329 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  35.71 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  37.18 
 
 
301 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  35.71 
 
 
318 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  37.93 
 
 
305 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  36.7 
 
 
306 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  37.62 
 
 
313 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  34.1 
 
 
318 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  35.6 
 
 
319 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  35.8 
 
 
326 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  37.58 
 
 
308 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  37.3 
 
 
313 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  37.3 
 
 
313 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  37.3 
 
 
306 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  36.58 
 
 
300 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  36.04 
 
 
300 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  36.16 
 
 
299 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  35.39 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  36.08 
 
 
298 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  34.69 
 
 
312 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  48.67 
 
 
158 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  32.79 
 
 
134 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>