43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3043 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  100 
 
 		 318 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  55.59 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  51.43 
 
 		 331 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  51.43 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  53.4 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  51.72 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  53.18 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  40.67 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  39.67 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  42.09 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  39.33 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  40.13 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  40.13 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  38.36 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  39.33 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  38.1 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  37.05 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  38.87 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  37.05 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  38.21 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  38 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  38.87 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  37.07 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  37.33 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  37.27 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  36.72 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  36.72 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  37.22 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  37.29 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  36.88 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  38.19 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  35.95 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  36 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  39.46 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  37 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  36.86 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  34.1 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  35.24 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  35.35 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  33.64 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  33.02 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  35.14 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>