42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0483 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  47.75 
 
 		 313 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  47.22 
 
 		 314 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  48.15 
 
 		 318 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  47.22 
 
 		 314 aa  103  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  50.91 
 
 		 304 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  45.95 
 
 		 301 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  47.22 
 
 		 319 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  48.62 
 
 		 322 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  45.45 
 
 		 301 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  39.64 
 
 		 340 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  49.52 
 
 		 306 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  43.64 
 
 		 306 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  42.73 
 
 		 306 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  41.44 
 
 		 300 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  43.52 
 
 		 298 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  41.44 
 
 		 300 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  46.67 
 
 		 305 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  45.71 
 
 		 302 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  43.93 
 
 		 300 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  43.93 
 
 		 300 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  39.62 
 
 		 298 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  38.53 
 
 		 329 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  40.37 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  37.61 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  39.45 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  39.6 
 
 		 301 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  40 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  35.78 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  34.92 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 331 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  41.35 
 
 		 312 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  35.48 
 
 		 326 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  36.7 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  34.86 
 
 		 331 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  35.85 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  35.85 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  32.79 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  34.26 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  34.91 
 
 		 306 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  30.16 
 
 		 350 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  27.78 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>