43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1318 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  99.67 
 
 
300 aa  615  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  67.44 
 
 
306 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  64.9 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  66.78 
 
 
306 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  65 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  65.55 
 
 
301 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  66.56 
 
 
301 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  67.59 
 
 
314 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  56.37 
 
 
314 aa  345  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  57.01 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  56.19 
 
 
319 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  55.25 
 
 
298 aa  321  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  54.25 
 
 
306 aa  316  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  50.34 
 
 
322 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  50.93 
 
 
326 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  52.84 
 
 
313 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  52.84 
 
 
313 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  51.17 
 
 
302 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  52.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  51.34 
 
 
305 aa  292  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  52.82 
 
 
301 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  51.83 
 
 
306 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  51.84 
 
 
313 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  52.17 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  52.41 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  52.17 
 
 
300 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  50.84 
 
 
299 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  52.68 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  48.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  45.61 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  44.98 
 
 
335 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  44.66 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  43.32 
 
 
331 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  43.32 
 
 
331 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  43.97 
 
 
329 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  44.12 
 
 
308 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  42.36 
 
 
335 aa  232  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  40.13 
 
 
318 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  41.72 
 
 
350 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  38.76 
 
 
331 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  38 
 
 
158 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  41.44 
 
 
134 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>