43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0369 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  100 
 
 
300 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  92 
 
 
300 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  92 
 
 
300 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  68.56 
 
 
305 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  68.23 
 
 
302 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  66.11 
 
 
313 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  66.56 
 
 
312 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  66.11 
 
 
313 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  65.89 
 
 
299 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  64.88 
 
 
306 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  65 
 
 
313 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  62.62 
 
 
328 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  64.9 
 
 
301 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  65.89 
 
 
298 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  60.74 
 
 
326 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  52.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  52.84 
 
 
300 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  53.16 
 
 
301 aa  288  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  51.99 
 
 
313 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  50.5 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  54.82 
 
 
301 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  52.82 
 
 
306 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  52.49 
 
 
306 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  52.04 
 
 
314 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  49.02 
 
 
314 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  47.1 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  46.6 
 
 
318 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  47.3 
 
 
298 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  46.77 
 
 
327 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  45.39 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  42.86 
 
 
308 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  41.67 
 
 
331 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  45.12 
 
 
322 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  41.35 
 
 
331 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  41.56 
 
 
329 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  41.03 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  39.73 
 
 
340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  36.88 
 
 
318 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  38.99 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  39.16 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  36.58 
 
 
331 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  39.31 
 
 
158 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  40.37 
 
 
134 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>