42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1962 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  92.11 
 
 		 350 aa  278  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  76.67 
 
 		 335 aa  228  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  45.39 
 
 		 340 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  48.67 
 
 		 331 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  43.51 
 
 		 322 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  39.33 
 
 		 298 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  39.6 
 
 		 306 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  36.91 
 
 		 301 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  36.77 
 
 		 305 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  35.54 
 
 		 314 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  38 
 
 		 300 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  38.93 
 
 		 306 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  38 
 
 		 300 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  37.93 
 
 		 302 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  36.24 
 
 		 313 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  35.67 
 
 		 313 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  33.33 
 
 		 318 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  40.41 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  33.13 
 
 		 319 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  39.04 
 
 		 300 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  32.74 
 
 		 306 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  39.04 
 
 		 300 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  39.31 
 
 		 300 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  34.25 
 
 		 326 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  37.84 
 
 		 327 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  35.57 
 
 		 314 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  35.62 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  38.36 
 
 		 331 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  38.36 
 
 		 331 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  41.1 
 
 		 308 aa  94.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  38.1 
 
 		 329 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  32.9 
 
 		 313 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  32.9 
 
 		 313 aa  93.6  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  39.16 
 
 		 335 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  34.46 
 
 		 304 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  31.72 
 
 		 299 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  31.85 
 
 		 306 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  32.88 
 
 		 328 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  35.07 
 
 		 298 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  33.56 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  35.14 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>