43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3975 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  87.96 
 
 
313 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  87.96 
 
 
313 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  83.99 
 
 
306 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  69.77 
 
 
312 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  69.9 
 
 
299 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  64.88 
 
 
302 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  63.86 
 
 
328 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  64.88 
 
 
305 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  66.89 
 
 
301 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  65 
 
 
300 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  64.88 
 
 
300 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  65.89 
 
 
298 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  64.55 
 
 
300 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  61.16 
 
 
326 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  50.83 
 
 
313 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  51.84 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  51.84 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  52 
 
 
301 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  49.17 
 
 
304 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  52.68 
 
 
306 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  51.82 
 
 
306 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  53.24 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  48.04 
 
 
314 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  51.32 
 
 
301 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  45.34 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  46.6 
 
 
318 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  46.45 
 
 
319 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  47.06 
 
 
306 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  46.1 
 
 
298 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  41.88 
 
 
308 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  44.3 
 
 
322 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  39.75 
 
 
335 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  39.68 
 
 
331 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  38.1 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  42.09 
 
 
340 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  39.55 
 
 
331 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  41.56 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  37.9 
 
 
335 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  37.27 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  37.62 
 
 
331 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  35.67 
 
 
158 aa  102  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  33.94 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>