58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1746 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  100 
 
 		 324 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  100 
 
 		 324 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13670  transposase  44.34 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  40.7 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  47.16 
 
 		 236 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  38.3 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  38.3 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  38.3 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  33.08 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  31.42 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00993  transposase  42.86 
 
 		 146 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  44.25 
 
 		 110 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  30.16 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  28.97 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  26.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  26.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  26.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  26.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  26.64 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1041  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.635396  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03470  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04730  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.169012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03560  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04110  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.416207  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06960  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.482764  normal  0.143692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10580  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00897005  hitchhiker  0.0000000184484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12940  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20710  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24150  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24330  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26770  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27120  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03170  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0725  putative transposase  26.9 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  24.41 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  23.19 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0890  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0889  hypothetical protein  32.65 
 
 		 477 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  23.95 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  24.41 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0140  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.6 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  25.26 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  25.26 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  25.26 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0667  Insertion element protein  38.96 
 
 		 90 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0449  Insertion element protein  38.96 
 
 		 90 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0043  IS1, transposase orfA  38.96 
 
 		 90 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3779  hypothetical protein  27.83 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0674  hypothetical protein  27.83 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0561774  normal  0.911403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3867  hypothetical protein  27.83 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5052  protein of unknown function DUF746  35.48 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2385  hypothetical protein  39.02 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  22.97 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  22.97 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  22.97 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  22.97 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  22.77 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>