159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1232 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  49.46 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  49.46 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  49.46 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  49.46 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  49.46 
 
 
217 aa  172  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  30.58 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  31.46 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  32.85 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  33.06 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  31.94 
 
 
290 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  27.86 
 
 
313 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  30.51 
 
 
314 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1278  ISSpo3, transposase  30.88 
 
 
292 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  31.5 
 
 
293 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  29.14 
 
 
323 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  26.43 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2385  hypothetical protein  27.52 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305905  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  30.48 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  25.48 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0206  putative transposase  26.01 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0693887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  26.98 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0407  transposase, putative  29.84 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  28.11 
 
 
359 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  28.11 
 
 
366 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  28.11 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  28.11 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  28.11 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  28.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  28.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  28.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  28.69 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  27.43 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  27.86 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  27.43 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  26.59 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01914  ISXoo10 transposase  27.86 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.474572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  26.81 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0459  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0069  hypothetical protein  23.99 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2509  hypothetical protein  23.99 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000139438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3178  hypothetical protein  23.99 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1109  hypothetical protein  24.33 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  28.29 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  28.29 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  28.63 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  27.51 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  27.51 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  27.72 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  27.8 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  27.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  26.98 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1505  ISSod11, transposase  29.75 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000861665  hitchhiker  0.00324548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  27.51 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  27.72 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  28.41 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  27.72 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  26.98 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  26.49 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  27.8 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  26.98 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03202  ISXo2 putative transposase  26.62 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  26.98 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  26.98 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  27.17 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  25.88 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>