11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1041 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.635396  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  38 
 
 		 319 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  33.33 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  33.33 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  33.33 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  38 
 
 		 342 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13670  transposase  37.11 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  35.56 
 
 		 324 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  35.56 
 
 		 324 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  34.65 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  41.82 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>