37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_13670  transposase  100 
 
 		 317 aa  490  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  47.16 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  47.16 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  37.85 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  35.75 
 
 		 319 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  36.41 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  35.8 
 
 		 342 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  35.8 
 
 		 342 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  35.8 
 
 		 342 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00993  transposase  41.13 
 
 		 146 aa  99  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4329  hypothetical protein  24.31 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  26.25 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  28.38 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  28.38 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  28.38 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  28.38 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03170  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27120  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26770  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24330  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24150  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20710  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12940  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10580  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00897005  hitchhiker  0.0000000184484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06960  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.482764  normal  0.143692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04730  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.169012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04110  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.416207  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03560  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03470  hypothetical protein  24.04 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0890  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  25 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  30.46 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  28.35 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1041  hypothetical protein  38.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.635396  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  26.35 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>