43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2468 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  100 
 
 		 319 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13670  transposase  34.17 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  36.64 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  35.27 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  32.64 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  27.62 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  27.62 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  27.62 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  32.13 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  32.13 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00993  transposase  38.28 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  25 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  25.95 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1041  hypothetical protein  38 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.635396  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  23.83 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  23.83 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  23.83 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  23.83 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  26.51 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  23.79 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  24.56 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  25.65 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0489  hypothetical protein  28.7 
 
 		 134 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4329  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  23.48 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  21.92 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  21.92 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  20.25 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  21.83 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  30.19 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  19.09 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>