51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_13670  transposase  100 
 
 		 317 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  100 
 
 		 236 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  44.65 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  44.65 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  36.09 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  36.19 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  31.79 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  34.5 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  34.5 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  34.5 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00993  transposase  41.13 
 
 		 146 aa  99.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  28.16 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  27.35 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  27.64 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  27.64 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  27.64 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  27.64 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24150  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.451022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04110  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.416207  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03560  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03470  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03170  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04730  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.169012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06960  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.482764  normal  0.143692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10580  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00897005  hitchhiker  0.0000000184484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12940  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20710  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27120  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26770  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24330  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  27.68 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  26.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4329  hypothetical protein  24.42 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1041  hypothetical protein  35.65 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.635396  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  27.85 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0890  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3161  hypothetical protein  31.07 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.446465  hitchhiker  0.00206023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3169  hypothetical protein  31.07 
 
 		 184 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000436228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1325  hypothetical protein  31.07 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00014986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0889  hypothetical protein  29.17 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5052  protein of unknown function DUF746  30.85 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0042  hypothetical protein  29.2 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000215832  normal  0.0470147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0140  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.36 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  24.2 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1329  hypothetical protein  30.1 
 
 		 139 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  22.96 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3779  hypothetical protein  32.69 
 
 		 472 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0674  hypothetical protein  32.69 
 
 		 438 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0561774  normal  0.911403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3867  hypothetical protein  32.69 
 
 		 439 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7313  hypothetical protein  29.81 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.0908026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>