13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4989 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  230  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00993  transposase  66.37 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  44.25 
 
 		 324 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  44.25 
 
 		 324 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  39.82 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  39.47 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13670  transposase  39.47 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  37.5 
 
 		 319 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  31.48 
 
 		 353 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  32.61 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  32.61 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  32.61 
 
 		 342 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0890  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>