22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2385 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2385  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305905  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  36.86 
 
 
307 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0407  transposase, putative  33.83 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  34.59 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  34.36 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  33.73 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  29.17 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  27.52 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  27.52 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  27.52 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  24.63 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  23.51 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  27.94 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  26.98 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  28.57 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  26.98 
 
 
294 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  26.98 
 
 
294 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  26.98 
 
 
294 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  26.98 
 
 
294 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0062  hypothetical protein  31.07 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0140  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  26.98 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  19.45 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>