31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2368 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  73.19 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  69.45 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  41.26 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0407  transposase, putative  44.73 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  37.8 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2385  hypothetical protein  34.59 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  31.6 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  31.6 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  31.6 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  28 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  28 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  28 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  28 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  28 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  23.93 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  29.87 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1099  hypothetical protein  24.6 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  28.07 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2705  ISTde3, transposase  24.4 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  25.27 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  22.62 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2800  hypothetical protein  28.28 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0521952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  23.19 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  23.19 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  22.87 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  23.25 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  23.25 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  23.25 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  22.91 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>