24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0407 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0407  transposase, putative  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2368  transposase, putative  44.73 
 
 		 290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1219  transposase, putative  42.96 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0871932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0714  transposase, putative  44.36 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0973  transposase, putative  39.01 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.894035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1567  transposase, putative  38.97 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2385  hypothetical protein  33.83 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  29.18 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  29.18 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  29.18 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  25.61 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  26.22 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0324  IS1016C2 transposase  26.72 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00443664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1709  transposase  26.72 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1679  transposase  26.72 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1116  transposase  26.72 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.651522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0642  insertion element IS1016 transposase  26.72 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1254  putative ISH4 transposase  26.06 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  26.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  26.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  26.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  26.06 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4134  putative transposase  29.71 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436549  normal  0.202806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>